苍古世界再启时钟，上一季残留的盟约与背叛在第二季被拉开，新旧天选者必须在天地断层中抉择信仰与生存。
上季后十年，苍古大陆表面归于平静，却不断传出“古钟停摆日”事件。柳澜辞官返乡，成了给伤兵配药的小医师；林烨带着残缺卷轴返乡求师，却发现朝廷密探早已渗入医馆。更深处，天界使者把各国“苍古石”列为禁运资产，要求毁掉所有古地遗迹，表面理由是防止再起乱象。众人以为只是权力收编，直到第三支军队占领矿谷，开启了可逆时间井。剧本采用双线结构：现实线是政治博弈与粮道封锁，神话线是梦境和预言的回返。柳澜与林烨在寻亲与夺石的过程中发现，真正的黑幕是当年和平条约中的“代价条文”，每代继承者都要舍弃一座城池的记忆。最终为阻止苍古之绊扩散，他们发动“弃城仪式”，以个人记忆为代价暂时封印裂缝，并留下“再见之约”给下一季。
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1941年的上海，一个代号“鹤”的中共特工，必须在一周内找出日军内部的“风声”卧底。
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圣约号殖民飞船收到陌生星球信号，降落后面临的不是新家园，而是生化人大卫的造物主实验场。
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1985年的一座架空王朝后宫里，出身卑微的女史意外卷入储位之争，她必须在谎言、情感与忠诚之间选出唯一活路。
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考古队在塔克拉玛干发现一扇刻满未知文字的石门，开门后里面不是遗迹，而是另一个活着的沙漠。
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搬进新公寓的男人发现隔壁13号的住户，与他每晚梦见的连环杀手一模一样。
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亚洲版改编，能看见鬼魂的韩国女巫与不愿投胎的日本武士鬼魂相爱，发现彼此的相遇已有十三世轮回。